Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms