Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms