Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms