Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Taf1cQ6PDZ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Taf1cQ6PDZ2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Taf1cQ6PDZ2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Taf1cQ6PDZ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Taf1cQ6PDZ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Taf1cQ6PDZ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Taf1cQ6PDZ2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Taf1cQ6PDZ2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Taf1cQ6PDZ2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Taf1cQ6PDZ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf1cQ6PDZ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Taf1cQ6PDZ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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