Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms