Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms