Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gapvd1Q6PAR5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms