Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Carmil1Q6EDY6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms