Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms