Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms