Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms