Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Odf1Q61999 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Odf1Q61999 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Odf1Q61999 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Odf1Q61999 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Odf1Q61999 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Odf1Q61999 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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