Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AtrxQ61687 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AtrxQ61687 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms