Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim25Q61510 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms