Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf4bQ61136 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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