Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17laQ61068 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms