Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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JrkQ60976 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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JrkQ60976 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms