Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Grik1Q60934 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik1Q60934 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Grik1Q60934 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Grik1Q60934 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Grik1Q60934 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Grik1Q60934 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms