Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms