Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms