Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf1Q5ND28 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms