Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx33Q4VAA7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx33Q4VAA7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms