Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms