Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms