Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms