Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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