Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms