Protein–RNA interactions for Protein: Q3US96

Gm10735, Predicted gene 10735, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10735Q3US96 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10735Q3US96 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms