Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp30Q3UN04 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp30Q3UN04 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp30Q3UN04 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp30Q3UN04 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp30Q3UN04 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp30Q3UN04 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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