Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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