Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms