Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf224Q3UIW8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf224Q3UIW8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms