Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms