Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms