Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms