Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc13Q3TIR1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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