Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
StumQ0VBF8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms