Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MitfQ08874 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms