Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms