Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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