Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms