Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms