Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RykQ01887 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RykQ01887 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RykQ01887 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RykQ01887 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RykQ01887 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RykQ01887 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RykQ01887 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RykQ01887 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms