Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top2aQ01320 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms