Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HmgcrQ01237 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms