Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms