Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga4Q00651 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms