Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cited1P97769 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms