Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms