Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vgll3P85442 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms